La Confédération et les cantons réglementent et financent le domaine FRI conformément à leurs compétences et à leurs responsabilités en tant que collectivités responsables, telles qu’elles sont définies dans la Constitution fédérale. Ils collaborent étroitement là où leurs champs de compétences se rejoignent.
La subsidiarité, l’autonomie et la collaboration fédéraliste constituent les principes politiques fondamentaux du système de la formation, de la recherche et de l’innovation, et ce, à tous les niveaux. Par conséquent, la Confédération intervient lorsque des tâches excèdent les possibilités des cantons ou nécessitent une réglementation uniforme. Elle exerce une compétence de réglementation entre autres dans le domaine de la formation professionnelle, assume la responsabilité du domaine des EPF et constitue la principale source d’encouragement public pour la recherche et l’innovation et pour la coopération internationale dans le domaine FRI.